MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 53188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021082	CTT	2	6	312064	312069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021082	A	6	6	312086	312091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021082	CA	3	6	312095	312100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_021082	A	6	6	312108	312113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021082	T	6	6	312131	312136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021082	ATT	2	6	312137	312142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021082	TTA	2	6	312232	312237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885016
6008	NC_021082	TGT	2	6	312383	312388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885016
6009	NC_021082	GTT	2	6	312452	312457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885016
6010	NC_021082	ACT	2	6	312527	312532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885016
6011	NC_021082	GAT	2	6	312595	312600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885016
6012	NC_021082	GAA	2	6	312682	312687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885016
6013	NC_021082	CAA	2	6	312690	312695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885016
6014	NC_021082	A	6	6	312712	312717	100 %	0 %	0 %	0 %	482885016
6015	NC_021082	GGC	2	6	312718	312723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885016
6016	NC_021082	CAC	3	9	312814	312822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885016
6017	NC_021082	GCTT	2	8	312946	312953	0 %	50 %	25 %	25 %	482885016
6018	NC_021082	CTA	2	6	313074	313079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885016
6019	NC_021082	CTTTG	2	10	313294	313303	0 %	60 %	20 %	20 %	482885016
6020	NC_021082	TGGC	2	8	313316	313323	0 %	25 %	50 %	25 %	482885016
6021	NC_021082	CAA	2	6	313338	313343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885016
6022	NC_021082	CCG	2	6	313387	313392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885016
6023	NC_021082	TCG	2	6	313524	313529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885016
6024	NC_021082	AAC	2	6	313595	313600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_021082	A	6	6	313608	313613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_021082	T	6	6	313633	313638	0 %	100 %	0 %	0 %	482885017
6027	NC_021082	ATTG	2	8	313639	313646	25 %	50 %	25 %	0 %	482885017
6028	NC_021082	AGCA	2	8	313652	313659	50 %	0 %	25 %	25 %	482885017
6029	NC_021082	GTA	2	6	313740	313745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885017
6030	NC_021082	ATC	2	6	313751	313756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885017
6031	NC_021082	CTGCC	2	10	313778	313787	0 %	20 %	20 %	60 %	482885017
6032	NC_021082	CTG	2	6	313791	313796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885017
6033	NC_021082	GTTG	2	8	314005	314012	0 %	50 %	50 %	0 %	482885017
6034	NC_021082	A	6	6	314070	314075	100 %	0 %	0 %	0 %	482885017
6035	NC_021082	CAC	2	6	314113	314118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885017
6036	NC_021082	A	6	6	314120	314125	100 %	0 %	0 %	0 %	482885017
6037	NC_021082	TC	3	6	314146	314151	0 %	50 %	0 %	50 %	482885017
6038	NC_021082	TGA	2	6	314152	314157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885017
6039	NC_021082	TCT	2	6	314314	314319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885018
6040	NC_021082	ATT	2	6	314353	314358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885018
6041	NC_021082	TCA	2	6	314443	314448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885018
6042	NC_021082	ACGCA	2	10	314496	314505	40 %	0 %	20 %	40 %	482885018
6043	NC_021082	CAG	2	6	314571	314576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885018
6044	NC_021082	GCC	2	6	314581	314586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885018
6045	NC_021082	AAG	2	6	314606	314611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885018
6046	NC_021082	ACC	2	6	314676	314681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885018
6047	NC_021082	TA	3	6	314715	314720	50 %	50 %	0 %	0 %	482885018
6048	NC_021082	TCA	2	6	314777	314782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885018
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6050	NC_021082	ATC	2	6	314888	314893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885019
6051	NC_021082	T	6	6	314896	314901	0 %	100 %	0 %	0 %	482885019
6052	NC_021082	GCA	2	6	314930	314935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885019
6053	NC_021082	TTG	2	6	314959	314964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885019
6054	NC_021082	AAT	2	6	314987	314992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885019
6055	NC_021082	GCATT	2	10	315056	315065	20 %	40 %	20 %	20 %	482885019
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6057	NC_021082	CGAA	2	8	315157	315164	50 %	0 %	25 %	25 %	482885019
6058	NC_021082	CCG	2	6	315225	315230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885019
6059	NC_021082	ATC	2	6	315340	315345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885019
6060	NC_021082	A	6	6	315380	315385	100 %	0 %	0 %	0 %	482885019
6061	NC_021082	CTC	2	6	315422	315427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482885020
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6063	NC_021082	CTGC	2	8	315512	315519	0 %	25 %	25 %	50 %	482885020
6064	NC_021082	T	6	6	315551	315556	0 %	100 %	0 %	0 %	482885020
6065	NC_021082	GCCA	2	8	315558	315565	25 %	0 %	25 %	50 %	482885020
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6068	NC_021082	CAATT	2	10	315927	315936	40 %	40 %	0 %	20 %	482885020
6069	NC_021082	CA	3	6	315943	315948	50 %	0 %	0 %	50 %	482885020
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6072	NC_021082	TTG	2	6	316104	316109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885020
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6074	NC_021082	TGT	2	6	316269	316274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885020
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6077	NC_021082	GCT	2	6	316370	316375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885020
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6081	NC_021082	TG	3	6	316465	316470	0 %	50 %	50 %	0 %	482885020
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6084	NC_021082	CTTG	2	8	316559	316566	0 %	50 %	25 %	25 %	482885020
6085	NC_021082	TCA	3	9	316649	316657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885020
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6091	NC_021082	CAT	2	6	316888	316893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885021
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6107	NC_021082	CGG	2	6	317808	317813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885022
6108	NC_021082	ACGGC	2	10	317839	317848	20 %	0 %	40 %	40 %	482885022
6109	NC_021082	CAG	2	6	317906	317911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885022
6110	NC_021082	AAT	2	6	317918	317923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885022
6111	NC_021082	CAA	2	6	318011	318016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885022
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6114	NC_021082	AAT	2	6	318224	318229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885022
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6119	NC_021082	ACC	2	6	318443	318448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885022
6120	NC_021082	ACCAA	2	10	318498	318507	60 %	0 %	0 %	40 %	482885022
6121	NC_021082	A	6	6	318543	318548	100 %	0 %	0 %	0 %	482885022
6122	NC_021082	AATA	2	8	318554	318561	75 %	25 %	0 %	0 %	482885022
6123	NC_021082	A	6	6	318567	318572	100 %	0 %	0 %	0 %	482885022
6124	NC_021082	A	6	6	318598	318603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_021082	CAA	2	6	318639	318644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_021082	T	6	6	318654	318659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_021082	AAAG	2	8	318709	318716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_021082	AAC	2	6	318738	318743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885023
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6152	NC_021082	GCC	2	6	319850	319855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885023
6153	NC_021082	TTC	2	6	319868	319873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885023
6154	NC_021082	TGA	2	6	319948	319953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885023
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6157	NC_021082	ATG	2	6	320099	320104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6158	NC_021082	AT	3	6	320204	320209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6159	NC_021082	AT	3	6	320263	320268	50 %	50 %	0 %	0 %	482885024
6160	NC_021082	TTCT	2	8	320269	320276	0 %	75 %	0 %	25 %	482885024
6161	NC_021082	CT	3	6	320340	320345	0 %	50 %	0 %	50 %	482885024
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6187	NC_021082	T	6	6	321410	321415	0 %	100 %	0 %	0 %	482885024
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6197	NC_021082	AT	4	8	321698	321705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6198	NC_021082	TAA	2	6	321708	321713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6199	NC_021082	TCAA	2	8	321714	321721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6200	NC_021082	TAT	2	6	321723	321728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6230	NC_021082	TGC	2	6	323408	323413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885025
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6233	NC_021082	CA	4	8	323557	323564	50 %	0 %	0 %	50 %	482885025
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6247	NC_021082	CAT	2	6	324149	324154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885025
6248	NC_021082	CGTT	2	8	324168	324175	0 %	50 %	25 %	25 %	482885025
6249	NC_021082	GCA	2	6	324177	324182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885025
6250	NC_021082	CCG	2	6	324231	324236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885025
6251	NC_021082	TCG	2	6	324315	324320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885025
6252	NC_021082	AGC	2	6	324344	324349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885025
6253	NC_021082	TTAA	2	8	324426	324433	50 %	50 %	0 %	0 %	482885025
6254	NC_021082	T	6	6	324446	324451	0 %	100 %	0 %	0 %	482885025
6255	NC_021082	ATC	2	6	324498	324503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885025
6256	NC_021082	TGG	2	6	324523	324528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885025
6257	NC_021082	CTA	2	6	324532	324537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885025
6258	NC_021082	CGGTA	2	10	324625	324634	20 %	20 %	40 %	20 %	482885025
6259	NC_021082	CAC	2	6	324754	324759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885025
6260	NC_021082	GTT	2	6	324776	324781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885025
6261	NC_021082	CAT	2	6	324788	324793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885025
6262	NC_021082	CGC	2	6	324875	324880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885025
6263	NC_021082	AC	3	6	324881	324886	50 %	0 %	0 %	50 %	482885025
6264	NC_021082	TCAA	2	8	324915	324922	50 %	25 %	0 %	25 %	482885025
6265	NC_021082	TTC	2	6	325047	325052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885025
6266	NC_021082	ACGG	2	8	325105	325112	25 %	0 %	50 %	25 %	482885025
6267	NC_021082	AAT	2	6	325113	325118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885025
6268	NC_021082	TTC	2	6	325131	325136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885025
6269	NC_021082	TAA	2	6	325214	325219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885025
6270	NC_021082	TAA	2	6	325322	325327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885025
6271	NC_021082	GAT	2	6	325370	325375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885025
6272	NC_021082	GTT	2	6	325412	325417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885025
6273	NC_021082	CGG	2	6	325431	325436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885025
6274	NC_021082	TCA	2	6	325525	325530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885025
6275	NC_021082	CCAT	2	8	325531	325538	25 %	25 %	0 %	50 %	482885025
6276	NC_021082	TTG	2	6	325545	325550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885025
6277	NC_021082	T	7	7	325594	325600	0 %	100 %	0 %	0 %	482885025
6278	NC_021082	TCTAAA	2	12	325659	325670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482885025
6279	NC_021082	TCA	2	6	325719	325724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885025
6280	NC_021082	TTC	2	6	325754	325759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885025
6281	NC_021082	TAA	2	6	325763	325768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885025
6282	NC_021082	TG	3	6	325903	325908	0 %	50 %	50 %	0 %	482885025
6283	NC_021082	ACG	2	6	325946	325951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885025
6284	NC_021082	CA	3	6	326026	326031	50 %	0 %	0 %	50 %	482885025
6285	NC_021082	T	6	6	326123	326128	0 %	100 %	0 %	0 %	482885025
6286	NC_021082	TTCG	2	8	326198	326205	0 %	50 %	25 %	25 %	482885025
6287	NC_021082	TTTG	2	8	326208	326215	0 %	75 %	25 %	0 %	482885025
6288	NC_021082	T	6	6	326246	326251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6289	NC_021082	GTT	2	6	326266	326271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6290	NC_021082	TGG	2	6	326277	326282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6291	NC_021082	CT	4	8	326437	326444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6292	NC_021082	TC	3	6	326476	326481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6293	NC_021082	ACC	2	6	326736	326741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885026
6294	NC_021082	ACC	2	6	326754	326759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885026
6295	NC_021082	GTT	2	6	326765	326770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885026
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6297	NC_021082	CATATA	2	12	326841	326852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482885026
6298	NC_021082	CAT	2	6	326894	326899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885026
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6303	NC_021082	CTT	2	6	327122	327127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885026
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6308	NC_021082	TCG	2	6	327412	327417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885026
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6310	NC_021082	GCTTC	2	10	327512	327521	0 %	40 %	20 %	40 %	482885026
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6313	NC_021082	TCTT	2	8	327658	327665	0 %	75 %	0 %	25 %	482885026
6314	NC_021082	CA	3	6	327671	327676	50 %	0 %	0 %	50 %	482885026
6315	NC_021082	TTTC	2	8	327692	327699	0 %	75 %	0 %	25 %	482885026
6316	NC_021082	ATG	2	6	327782	327787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885026
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6321	NC_021082	CA	3	6	328017	328022	50 %	0 %	0 %	50 %	482885026
6322	NC_021082	TCT	2	6	328057	328062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885026
6323	NC_021082	CAC	2	6	328193	328198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885026
6324	NC_021082	CA	3	6	328221	328226	50 %	0 %	0 %	50 %	482885026
6325	NC_021082	ACC	2	6	328368	328373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885026
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6327	NC_021082	TCG	2	6	328510	328515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885026
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6331	NC_021082	CTT	2	6	328586	328591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885026
6332	NC_021082	TTG	2	6	328693	328698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885026
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6334	NC_021082	CAC	2	6	328749	328754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885026
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6339	NC_021082	CTG	3	9	329030	329038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885026
6340	NC_021082	CGCAC	2	10	329107	329116	20 %	0 %	20 %	60 %	482885026
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6342	NC_021082	ACG	2	6	329178	329183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885026
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6349	NC_021082	CTT	2	6	329396	329401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885026
6350	NC_021082	TGG	2	6	329406	329411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885026
6351	NC_021082	CAT	2	6	329424	329429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885026
6352	NC_021082	CAAC	2	8	329441	329448	50 %	0 %	0 %	50 %	482885026
6353	NC_021082	AT	3	6	329494	329499	50 %	50 %	0 %	0 %	482885026
6354	NC_021082	ATA	2	6	329525	329530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885026
6355	NC_021082	AT	3	6	329659	329664	50 %	50 %	0 %	0 %	482885026
6356	NC_021082	TGC	2	6	329763	329768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885026
6357	NC_021082	ATG	2	6	329777	329782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885026
6358	NC_021082	TCA	2	6	329816	329821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885026
6359	NC_021082	TAT	2	6	329828	329833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885026
6360	NC_021082	GAA	2	6	329859	329864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885026
6361	NC_021082	GGT	2	6	329883	329888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885026
6362	NC_021082	AAT	2	6	329907	329912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885026
6363	NC_021082	ACG	2	6	329928	329933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885026
6364	NC_021082	TGCG	2	8	330008	330015	0 %	25 %	50 %	25 %	482885026
6365	NC_021082	GAA	2	6	330063	330068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885026
6366	NC_021082	TACCG	2	10	330192	330201	20 %	20 %	20 %	40 %	482885026
6367	NC_021082	CACG	2	8	330284	330291	25 %	0 %	25 %	50 %	482885026
6368	NC_021082	TTG	2	6	330346	330351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885026
6369	NC_021082	TGC	2	6	330394	330399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885026
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6371	NC_021082	T	6	6	330533	330538	0 %	100 %	0 %	0 %	482885026
6372	NC_021082	AT	3	6	330554	330559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6496	NC_021082	TGC	2	6	337832	337837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885037
6497	NC_021082	CGA	2	6	337904	337909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885037
6498	NC_021082	TTA	2	6	337917	337922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885037
6499	NC_021082	AAT	2	6	337980	337985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885037
6500	NC_021082	AC	3	6	338094	338099	50 %	0 %	0 %	50 %	482885037

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